RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 EGFL8Q99944 293 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 STRADBQ9C0K7 418 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 COG4Q9H9E3 785 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 VTI1BQ9UEU0 232 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 PISDQ9UG56 409 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ACSL5Q9ULC5 683 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 CDYLQ9Y232 598 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.66□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ITM2AO43736 263 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 NTRK1P04629 796 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 RPN2P04844 631 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 JMJD7P0C870 316 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 RPL14P50914 215 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 CCL7P80098 99 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 TLE1Q04724 770 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 DMPKQ09013 629 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 NFATC4Q14934 902 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 36.4
POLR1A-210ENST00000496892 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 MANEAQ5SRI9 462 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 FRMD7Q6ZUT3 714 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ARL10Q8N8L6 244 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 KYQ8NBH2 561 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ATL1Q8WXF7 558 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 WDR92Q96MX6 357 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 NPHS2Q9NP85 383 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 ARL15Q9NXU5 204 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 HAO1Q9UJM8 370 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 UNC13CQ8NB66 2214 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 RELNP78509 3460 aa13.65□□□□□ -0.22
POLR1A-210ENST00000496892 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 A0A1W2PQM1 296 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 AGRPO00253 132 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 NVLO15381 856 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CEACAM5P06731 702 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CCKBRP32239 447 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PIK3CGP48736 1102 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 HK3P52790 923 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ARFIP2P53365 341 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CYP4F2P78329 520 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ABRQ12979 859 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 UNC50Q53HI1 259 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 UNC5DQ6UXZ4 953 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ZFAND4Q86XD8 727 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 VRK3Q8IV63 474 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC138Q96M89 665 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM74Q96NL1 305 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 SORT1Q99523 831 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 WWOXQ9NZC7 414 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 FAM8A1Q9UBU6 413 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 MOSPD1Q9UJG1 213 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 DOLKQ9UPQ8 538 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PDE10AQ9Y233 779 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 NOTCH2Q04721 2471 aa13.64□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM202A6NGA9 273 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PRAMEF10O60809 474 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 GUCA1CO95843 209 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 ITIH1P19827 911 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PREPP48147 710 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CLCA4Q14CN2 919 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 TCEA2Q15560 299 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 PYCR3Q53H96 274 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 CES4AQ5XG92 561 aa13.63□□□□□ -0.23
POLR1A-210ENST00000496892 METRNLQ641Q3 311 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms