RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496492.5

TNIK-215, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNIK, Length 2,736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-215ENST00000496492 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.36□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.36□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.36□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.36□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 DGKBQ9Y6T7 804 aa7.36□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PTGES3LE9PB15 166 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 RFXANKO14593 260 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 SLC16A5O15375 505 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 XPNPEP2O43895 674 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 DPM1O60762 260 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 FTH1P02794 183 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 C21orf58P58505 322 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ZNF33BQ06732 778 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 SLC14A1Q13336 389 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 TSPAN33Q86UF1 283 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 SVOPQ8N4V2 548 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 VOPP1Q96AW1 172 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 TSSK3Q96PN8 268 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PITX2Q99697 317 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 NEURL2Q9BR09 285 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 HMG20AQ9NP66 347 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 GIN1Q9NXP7 522 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ARL15Q9NXU5 204 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 SRRDQ9UH36 339 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 MASP1P48740 699 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 WNT3P56703 355 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 TRIM73Q86UV7 250 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.35□□□□□ -1.23
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TNIK-215ENST00000496492 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 SCN3BQ9NY72 215 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 CPQQ9Y646 472 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 U3KQV3 271 aa7.35□□□□□ -1.23
TNIK-215ENST00000496492 PLXNA2O75051 1894 aa7.34□□□□□ -1.23
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