RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	ERG	P11308	486 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MPP1	Q00013	466 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB2	Q8N680	514 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FKBP10	Q96AY3	582 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NDC1	Q9BTX1	674 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ING2	Q9H160	280 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TENM4	Q6N022	2769 aa		16.6	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FITM1	A5D6W6	292 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	NIPSNAP2	O75323	286 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AHSG	P02765	367 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CBSL	P0DN79	551 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MAG	P20916	626 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SSTR1	P30872	391 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CBS	P35520	551 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	EMP3	P54852	163 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SOX8	P57073	446 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	IL10RA	Q13651	578 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLMAP	Q14BN4	828 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX35	Q5T0J7	233 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LCN10	Q6JVE6	187 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CNST	Q6PJW8	725 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM73	Q86UV7	250 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP5D	Q92835	1189 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	RUFY1	Q96T51	708 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSS2	Q9NR19	701 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	16.59	■□□□□ 0.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO1C	O00159	1063 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS4	P49798	205 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC12A2	P55011	1212 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TLE1	Q04724	770 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM7	Q14831	915 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX19	Q8NA77	164 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PTER	Q96BW5	349 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR54	Q9H977	334 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS7	Q9Y394	339 aa		16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	16.58	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GX78	115 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GFY	I3L273	518 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	MPC1L	P0DKB6	136 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIA3	P42263	894 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCN7	P51798	805 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NAB1	Q13506	487 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FCRL6	Q6DN72	434 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	RELL1	Q8IUW5	271 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GPATCH11	Q8N954	259 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SMPDL3A	Q92484	453 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM136A	Q96C01	138 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS39	Q96JC1	886 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	CPNE1	Q99829	537 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	C5AR2	Q9P296	337 aa		16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	16.57	■□□□□ 0.24
HDAC10-216	ENST00000489424	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		16.57	■□□□□ 0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms