RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 C12orf71A8MTZ7 269 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 hCG_2039718K7EN88 272 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 AKT1P31749 480 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SOX6P35712 828 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DAPP51397 102 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZNF235Q14590 738 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FAAH2Q6GMR7 532 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ERAP2Q6P179 960 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR52B6Q8NGF0 335 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PIK3R3Q92569 461 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MMP28Q9H239 520 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CD274Q9NZQ7 290 aa13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SEMA3DO95025 777 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CAPN1P07384 714 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 YES1P07947 543 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RRM2P31350 389 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CREMQ03060 361 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 IL10RBQ08334 325 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DUSP4Q13115 394 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLAMF1Q13291 335 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZSR9 355 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLC13A3Q8WWT9 602 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NECTIN4Q96NY8 510 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KRT84Q9NSB2 600 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DRGXA6NNA5 263 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GPR39O43194 453 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TLL1O43897 1013 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 HTR6P50406 440 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NUDT6P53370 316 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPS24P62847 133 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 Q5BKY6 102 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CARD16Q5EG05 197 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TAS1R1Q7RTX1 841 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 NOXA1Q86UR1 476 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ZFP14Q9HCL3 533 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MED16Q9Y2X0 877 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MEIOCA2RUB1 952 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TLR5O60602 858 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PRAMEF11O60813 436 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SCELO95171 688 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MLYCDO95822 493 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PRR35P0CG20 571 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 ITGAMP11215 1152 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TACR2P21452 398 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CA5AP35218 305 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SGSHP51688 502 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MADCAM1Q13477 382 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CPZQ66K79 652 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CLHC1Q8NHS4 586 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SNAPC3Q92966 411 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MAP6Q96JE9 813 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SPON2Q9BUD6 331 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 MTMR11A4FU01 709 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR6C70A6NIJ9 312 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 KERAO60938 352 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 FKBP9O95302 570 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 VIPP01282 170 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GRK5P34947 590 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PIK3CGP48736 1102 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 CXCR4P61073 352 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPL38P63173 70 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RPP38P78345 283 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SGO1Q5FBB7 561 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 RTP2Q5QGT7 225 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 GPR153Q6NV75 609 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 OR4L1Q8NH43 312 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 DNASE1L2Q92874 299 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 PDFQ9HBH1 243 aa13.11□□□□□ -0.31
NISCH-212ENST00000488380 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms