RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 IVLP07476 585 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 FURINP09958 794 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF28P17035 718 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAD52P43351 418 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAN2A2P49641 1150 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEOX1P50221 254 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCL11P51671 97 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PGDP52209 483 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDST2P52849 883 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PMS2P54278 862 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 HGFACQ04756 655 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF235Q14590 738 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYCP1Q15431 976 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNGA3Q16281 694 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAGE13Q4V321 117 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 VWA3BQ502W6 1294 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 WDR59Q6PJI9 974 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMEM135Q86UB9 458 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRIM74Q86UV6 250 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DTD2Q96FN9 168 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SPRY4Q9C004 299 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDST4Q9H3R1 872 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PDFQ9HBH1 243 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PQ67 120 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PJA2O43164 708 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DHHO43323 396 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TMCC2O75069 709 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CREG1O75629 220 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 NDUFA10O95299 355 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DDAH2O95865 285 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 UCHL3P15374 230 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 AMD1P17707 334 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 CTPS1P17812 591 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 MMP8P22894 467 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 FASLGP48023 281 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GZMKP49863 264 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 AP1S1P61966 158 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNAB1Q14722 419 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 NADK2Q4G0N4 442 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PYCR3Q53H96 274 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 KRT77Q7Z794 578 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF677Q86XU0 584 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SFRP1Q8N474 314 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPATCH11Q8N954 259 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 AP2M1Q96CW1 435 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 C7orf26Q96N11 449 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR6C1Q96RD1 312 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPHA2Q96T91 129 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR10A2Q9H208 303 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRRC19Q9H756 370 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 PADI1Q9ULC6 663 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 FZD10Q9ULW2 581 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCNK6Q9Y257 313 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms