RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480205.5

PSMD6-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-208	ENST00000480205	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205		J3KR12	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZW10	O43264	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SNX2	O60749	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RASSF9	O75901	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C9	P02748	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HKR1	P10072	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ACP5	P13686	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	COX6B1	P14854	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ITGA3	P26006	1051 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HTR1E	P28566	365 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PTGER4	P35408	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	USP8	P40818	1118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PRCP	P42785	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SUOX	P51687	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SEC24C	P53992	1094 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	KCNK10	P57789	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FOXI1	Q12951	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TUBB3	Q13509	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MEA1	Q16626	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CDO1	Q16878	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NRGN	Q92686	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MR1	Q95460	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ABCA4	P78363	2273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RASA4B	C9J798	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RASA4	O43374	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MED7	O43513	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ALOX12B	O75342	701 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	DDC	P20711	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NDUFA8	P51970	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	HSD11B2	P80365	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RAD51	Q06609	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ART3	Q13508	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PKP1	Q13835	747 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	IL11RA	Q14626	422 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SNX21	Q969T3	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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