RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 CXorf40BQ96DE9 158 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 FRG2BQ96QU4 278 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 LRRC61Q9BV99 259 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF839A8K0R7 811 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 LSM1O15116 133 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ATP5HO75947 161 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 CSF2P04141 144 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 CALB2P22676 271 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 PKLRP30613 574 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 E2F2Q14209 437 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NR6A1Q15406 480 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 RNF165Q6ZSG1 346 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 HNF4AP41235 474 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 DIO3P55073 304 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 OGFOD2Q6N063 350 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 LPCAT2Q7L5N7 544 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 WDR5BQ86VZ2 330 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 TMEM105Q8N8V8 129 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ACPTQ9BZG2 426 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 SLC28A1O00337 649 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 CDH1P12830 882 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 AP5B1Q2VPB7 878 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 WDR45BQ5MNZ6 344 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ATG9BQ674R7 924 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ADNP2Q6IQ32 1131 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 OR2L8Q8NGY9 312 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 WDR20Q8TBZ3 569 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 HAUS8Q9BT25 410 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf50Q9BV19 199 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 H0YIV9 168 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 RGS14O43566 566 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NME1P15531 152 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NXPH1P58417 271 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 SQLEQ14534 574 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 KIF2BQ8N4N8 673 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 FNDC5Q8NAU1 212 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 OR4E2Q8NGC2 313 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 WDR34Q96EX3 536 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NDUFS1P28331 727 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 NME5P56597 212 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 IMPG1Q17R60 797 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ASRGL1Q7L266 308 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 SPATA19Q7Z5L4 167 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 LONP2Q86WA8 852 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 FBXO27Q8NI29 283 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 SPNS1Q9H2V7 528 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 SLC40A1Q9NP59 571 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-207ENST00000472863 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ERVK-8P63133 956 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 RINLQ6ZS11 566 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 C17orf64Q86WR6 236 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 NAGSQ8N159 534 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 OR7G3Q8NG95 312 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LCN9Q8WX39 176 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KLHL29Q96CT2 875 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 VILLO15195 856 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 COX4I1P13073 169 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 KIF19Q2TAC6 998 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PAOXQ6QHF9 649 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF740Q8NDX6 193 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 OR9I1Q8NGQ6 314 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 OR2A1Q8NGT9 310 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CMTM5Q96DZ9 223 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PPP3R2Q96LZ3 170 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 EHD1Q9H4M9 534 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LAMA1P25391 3075 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SLC22A2O15244 555 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SLC2A4P14672 509 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 GPX3P22352 226 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HOMEZQ8IX15 550 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 FAM20CQ8IXL6 584 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SPHK1Q9NYA1 384 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CCDC167Q9P0B6 97 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 CPNE7Q9UBL6 633 aa26.5■■□□□ 1.83
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