RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469762.5

SMC4-210, Transcript of structural maintenance of chromosomes 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC4, Length 3,998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4-210ENST00000469762 CDKN3Q16667 212 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CACHD1Q5VU97 1274 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 OR4F3Q6IEY1 312 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 FAM151BQ6UXP7 276 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PROX1Q92786 737 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SLC38A4Q969I6 547 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 VOPP1Q96AW1 172 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SLC6A14Q9UN76 642 aa10□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 LRATO95237 230 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ATF6P18850 670 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MAGP20916 626 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 FPR1P21462 350 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PAX3P23760 479 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.814e-6■■■□□ 15.6
SMC4-210ENST00000469762 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ZNF404Q494X3 552 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SERPINA11Q86U17 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CLIP4Q8N3C7 705 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 GPR62Q9BZJ7 368 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MTMR11A4FU01 709 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 NUAK1O60285 661 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 RFPL2O75678 378 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CTGFP29279 349 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PPP3CCP48454 512 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SERPINB10P48595 397 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 DESI1Q6ICB0 168 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SVOPQ8N4V2 548 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PIH1D2Q8WWB5 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TESCQ96BS2 214 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SPC25Q9HBM1 224 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PGLSO95336 258 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.817e-64■■■■■ 337.8
SMC4-210ENST00000469762 KDELR2P33947 212 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MTAPQ13126 283 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SPATC1Q76KD6 591 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 DENND1CQ8IV53 801 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 HOMEZQ8IX15 550 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ITPAQ9BY32 194 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CHST8Q9H2A9 424 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 IL26Q9NPH9 171 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SCN3BQ9NY72 215 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 HCSTQ9UBK5 93 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 A6NL46 340 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PSMD11O00231 422 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 NBNO60934 754 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PRAMEF1O95521 474 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 NUDT7P0C024 238 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 GPX2P18283 190 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 S100A3P33764 101 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 VMACQ2NL98 169 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 CBLL1Q75N03 491 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 METTL4Q8N3J2 472 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TPK1Q9H3S4 243 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 AMBNQ9NP70 447 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 WWOXQ9NZC7 414 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ZNF229Q9UJW7 825 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.99□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ILVBLA1L0T0 632 aa9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 ISPDA4D126 451 aa9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 H0Y626 953 aa9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 TRIM16O95361 564 aa9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 DNTTP04053 509 aa9.98□□□□□ -0.81
SMC4-210ENST00000469762 GABRB1P18505 474 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms