RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GPR180	Q86V85	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ASB9	Q96DX5	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	APIP	Q96GX9	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CPXM1	Q96SM3	734 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TBCB	Q99426	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CPNE1	Q99829	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PORCN	Q9H237	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	INIP	Q9NRY2	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NUP205	Q92621	2012 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SCN1A	P35498	2009 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SBF1	O95248	1867 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	GBF1	Q92538	1859 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		G3V2L1	256 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983		M0QYV0	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MDM4	O15151	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	OGT	O15294	1046 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	METTL18	O95568	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MYF5	P13349	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MYF6	P23409	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CYP2F1	P24903	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ARL2	P36404	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	STT3A	P46977	705 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD8	P48556	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NR2C2	P49116	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	THBS3	P49746	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	LIMK2	P53671	638 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NME5	P56597	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PSME3	P61289	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MOG	Q16653	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	NRF1	Q16656	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ABCB4-208	ENST00000467983	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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