RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG9Q9H6U8 611 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PKP3Q9Y446 797 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087X1B8 175 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM221AA4D161 298 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BTN3A3O00478 584 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR1AO14656 332 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BET1O15155 118 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTA4O15217 222 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TLL1O43897 1013 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINF2P08697 491 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF30P17039 623 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA2P29317 976 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC1A2P43004 574 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX5P45973 191 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SRP54P61011 504 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC5Q00444 222 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACY1Q03154 408 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKG2Q13237 762 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TNK1Q13470 666 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MADCAM1Q13477 382 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RCAN2Q14206 197 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GNA13Q14344 377 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KYAT1Q16773 422 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ5Q5HYK3 327 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 IER5Q5VY09 327 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM171BQ6P995 826 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL7BQ6UX53 244 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF139Q8WU17 664 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXW5Q969U6 566 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TESCQ96BS2 214 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 BCO2Q9BYV7 579 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FZD8Q9H461 694 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP3A43Q9HB55 503 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 AMBNQ9NP70 447 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR45Q9Y5Y3 372 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TSC2P49815 1807 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF487B1APH4 448 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS4O75173 837 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CILPO75339 1184 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CPB1P15086 417 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 GGT1P19440 569 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN3P26045 913 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX6P35712 828 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV6P41212 452 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3CBP42338 1070 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNC1P48547 511 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV1P50549 477 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F2P78329 520 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A3Q01959 620 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4F3Q08477 520 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf67Q0P5P2 114 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF12Q16514 161 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC50Q53HI1 259 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4Z1Q86W10 505 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TMC8Q8IU68 726 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PTERQ96BW5 349 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZPBPQ9BS86 351 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF302Q9NR11 478 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 COX16Q9P0S2 106 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SCML1Q9UN30 329 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 USP3Q9Y6I4 520 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 B4DXG7 233 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 AZIN1O14977 448 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK14O94921 469 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HSMCR30P0CW71 290 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms