RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHIT1Q13231 466 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 E2F2Q14209 437 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ICE2Q659A1 982 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATG9BQ674R7 924 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4F6Q8NGB9 312 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR34Q96EX3 536 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIKE1Q9BRV8 207 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF225Q9UK10 706 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAF6Q9Y4K3 522 aa16.35■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 E7EQ34 232 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 AZIN1O14977 448 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLRT2O43155 660 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CRCPO75575 148 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 WFS1O76024 890 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4F21O95013 312 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HGFP14210 728 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 AMD1P17707 334 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 DRD4P21917 467 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMPK1P30085 196 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNF4AP41235 474 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 XKR6Q5GH73 641 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 LETMD1Q6P1Q0 360 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2L3Q8NG85 312 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10G6Q8NH81 332 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAT6Q93015 286 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDK15Q96Q40 435 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PELI2Q9HAT8 420 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDH15Q96QU1 1955 aa16.34■□□□□ 0.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1B0GTL3 188 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSAPA4D1B5 854 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM107AO95990 144 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHEK2O96017 543 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROS1P07225 676 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 JUPP14923 745 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMB5P28074 263 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPZBP47756 277 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPLD1P80108 840 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAPTM5Q13571 262 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOC2AQ14183 400 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAA25Q14CX7 972 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KANK2Q63ZY3 851 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDYL2Q8N8U2 506 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 METTL6Q8TCB7 284 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGR3Q8TD06 166 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2A14Q96R47 310 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDEM2Q9BV94 578 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB33BQ9H082 229 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PNPOQ9NVS9 261 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.33■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HDAC3O15379 428 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN1P07384 714 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KITP10721 976 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CKMT1AP12532 417 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDH1P12830 882 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 UGT2B7P16662 529 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCR2P25025 360 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALDH4A1P30038 563 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMOX2P30519 316 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCR8P51685 355 aa16.32■□□□□ 0.2
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROX2Q3B8N5 592 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms