RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 C5AR2Q9P296 337 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SOCS6O14544 535 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 NRDCO43847 1150 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 KIF5CO60282 957 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ALBP02768 609 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ALPPP05187 535 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ERVK-10P10266 1014 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MMP11P24347 488 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 RBBP7Q16576 425 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PKP4Q99569 1192 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 WDR54Q9H977 334 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 TAC3Q9UHF0 121 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OR2A25A4D2G3 310 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FITM1A5D6W6 292 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SDR42E2A6NKP2 422 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 H0YGG7 62 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MYO1CO00159 1063 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FFAR3O14843 346 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GPR42O15529 346 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SEMA7AO75326 666 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ONECUT2O95948 504 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CATP04040 527 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 RNF224P0DH78 156 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ERGP11308 486 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GP1BBP13224 206 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SLC1A2P43004 574 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CLCN7P51798 805 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MPP1Q00013 466 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SMPDL3AQ92484 453 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 INPP5DQ92835 1189 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PBKQ96KB5 322 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CABS1Q96KC9 395 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 C10orf90Q96M02 699 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CRB3Q9BUF7 120 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 COL12A1Q99715 3063 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MLNP12872 115 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 GLRBP48167 497 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PNLIPRP1P54315 467 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NR6A1Q15406 480 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 HIF1AQ16665 826 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 FBXO42Q6P3S6 717 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ADCK2Q7Z695 626 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 IQCKQ8N0W5 287 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SLC35F6Q8N357 371 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MCUQ8NE86 351 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PRR7Q8TB68 274 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 COG1Q8WTW3 980 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MIEF2Q96C03 454 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 GPR21Q99679 349 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.83□□□□□ -0.04
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