RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 R4GN57 208 aa17.17■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR5K4A6NMS3 321 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF10AO00220 468 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 DCTN3O75935 186 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 NEK2P51955 445 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 HHEXQ03014 270 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 GRIK2Q13002 908 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SHBQ15464 509 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 C17orf64Q86WR6 236 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 RNF175Q8N4F7 328 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR2T11Q8NH01 316 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ERP27Q96DN0 273 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 PLCD4Q9BRC7 762 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 NMUR2Q9GZQ4 415 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SPNS1Q9H2V7 528 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SMOC1Q9H4F8 434 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ARMCX1Q9P291 453 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.16■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 TMEM131Q92545 1883 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ISM1B1AKI9 464 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 LMO7DNF2Z398 122 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 BTN3A3O00478 584 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 WFS1O76024 890 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 JUPP14923 745 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 NXPE4Q6UWF7 544 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SLC9B2Q86UD5 537 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 FITM2Q8N6M3 262 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR2I1PQ8NGU4 316 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 TUBGCP3Q96CW5 907 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 CATSPER2Q96P56 530 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 HAUS8Q9BT25 410 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 IL21RQ9HBE5 538 aa17.15■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR6C74A6NCV1 312 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 CCT8L1PA6NM43 557 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 NOBOXO60393 691 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 PCNAP12004 261 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 GRHL2Q6ISB3 625 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ARL14Q8N4G2 192 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 KYQ8NBH2 561 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 HMGCLL1Q8TB92 370 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 AKTIPQ9H8T0 292 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.14■□□□□ 0.34
LTV1-201ENST00000367576 PEX11AO75192 247 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ULK1O75385 1050 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 PDYNP01213 254 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 KRT6AP02538 564 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 KRT6BP04259 564 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 KRT6CP48668 564 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 BIRC2Q13490 618 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 DUOXA1Q1HG43 343 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 HLA-BQ31612 363 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 GALNTL6Q49A17 601 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 XKR7Q5GH72 579 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 LIPJQ5W064 366 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ICE2Q659A1 982 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ATG9BQ674R7 924 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 C6orf89Q6UWU4 347 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ADCK2Q7Z695 626 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A45Q8N413 288 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ZNF740Q8NDX6 193 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 CCDC28BQ9BUN5 200 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 SNX6Q9UNH7 406 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 KLHL20Q9Y2M5 609 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa17.14■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 MUC3AQ02505 3323 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 GSAPA4D1B5 854 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 NRP2O60462 931 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 HMGCS1Q01581 520 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 TRIM61Q5EBN2 209 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 TMEM26Q6ZUK4 368 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 TRIM73Q86UV7 250 aa17.13■□□□□ 0.33
LTV1-201ENST00000367576 ACTRT2Q8TDY3 377 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms