RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa-3.78□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRAPQ86VF7 1730 aa-3.78□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCN8AQ9UQD0 1980 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PQD8 194 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTGES3LE9PB15 166 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F6UB75 175 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDM4O15151 490 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITM2AO43736 263 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFS2O75306 463 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPM1BO75688 479 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDK14O94921 469 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EML2O95834 649 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KNG1P01042 644 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPPAP01160 153 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV1-44P01699 117 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTR1AP08908 422 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NUDT17P0C025 328 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTAFRP25105 342 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRD2P25440 801 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJB2P25686 324 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TDO2P48775 406 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNA2P51530 1060 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLK1P53350 603 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT4P56705 351 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FXYD6P3P58550 94 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPS26P62854 115 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC34A1Q06495 639 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEUROD2Q15784 382 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRTGQ2VWP7 1150 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf47Q569G3 176 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTX3Q5HYI7 312 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLRA4Q5JXX5 417 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC62Q6P9F0 684 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF773Q6PK81 442 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPZL3Q6UWV2 235 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM47EQ6ZV65 393 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GHDCQ8N2G8 530 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM26EQ8N5C1 309 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC155Q8N6L0 562 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLDN22Q8N7P3 220 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC35G3Q8N808 338 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLPP5Q8NEB5 264 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR2L3Q8NG85 312 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR52P1PQ8NH57 321 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABHD4Q8TB40 342 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIGOQ8TEQ8 1089 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM216AQ8WUB2 273 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HPSE2Q8WWQ2 592 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LEAP2Q969E1 77 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ULK4Q96C45 1275 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNX22Q96L94 193 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VGLL1Q99990 258 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC28BQ9BUN5 200 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTDSS2Q9BVG9 487 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP27Q9H306 513 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASAH2Q9NR71 780 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DDIT4Q9NX09 232 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GDAP2Q9NXN4 497 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SENP1Q9P0U3 644 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTNNA3Q9UI47 895 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FZD10Q9ULW2 581 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MSRB2Q9Y3D2 182 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JRKLQ9Y4A0 524 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBR1Q8IWV7 1749 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLEC1Q9Y238 1755 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX6-3A6NJ46 265 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM64CA6NLI5 447 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HACD1B0YJ81 288 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLRF2D3W0D1 207 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 E9PAM4 449 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H7C1Q1 480 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HGSO14964 777 aaPredicted RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV1-51P01701 117 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV6-57P01721 117 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD7P09564 240 aa-3.8□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms