RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 OR2A25A4D2G3 310 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CDC7O00311 574 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 KATNA1O75449 491 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf189Q5VU69 101 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SBSNQ6UWP8 590 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZUFSPQ96AP4 578 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC138Q96M89 665 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ATG10Q9H0Y0 220 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 TXNDC16Q9P2K2 825 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.88■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0J9YVX5 310 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF839A8K0R7 811 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 TARM1B6A8C7 271 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 GCGRP47871 477 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 NFKB2Q00653 900 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RHDQ02161 417 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FAM69BQ5VUD6 431 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 AGTRAPQ6RW13 159 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FAM198BQ6UWH4 519 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RNF44Q7L0R7 432 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PAQR7Q86WK9 346 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 OR4N4Q8N0Y3 316 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA6LQ8N4H0 392 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 EXTL1Q92935 676 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 GPAMQ9HCL2 828 aa25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CHD6Q8TD26 2715 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CAPN1P07384 714 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 POU4F1Q01851 419 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CDC20Q12834 499 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF425Q6IV72 752 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf46Q6P387 395 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF285Q96NJ3 590 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FMO2Q99518 471 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 EFHD1Q9BUP0 239 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ACTL8Q9H568 366 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.86■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 GUCA1CO95843 209 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FURINP09958 794 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 NAE1Q13564 534 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00303Q3SY05 128 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO42Q6P3S6 717 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RELL1Q8IUW5 271 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PLD3Q8IV08 490 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 MED8Q96G25 268 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 GBP5Q96PP8 586 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 POPDC3Q9HBV1 291 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ARL15Q9NXU5 204 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.85■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 MGAQ8IWI9 3026 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 C21orf140B9A014 251 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ERVH48-1M5A8F1 160 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 MED26O95402 600 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 SLC12A2P55011 1212 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 TBR1Q16650 682 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 GRTP1Q5TC63 336 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 TLDC1Q6P9B6 456 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CMC1Q7Z7K0 106 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 NBEAQ8NFP9 2946 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 PYCR2Q96C36 320 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 FAM129AQ9BZQ8 928 aa25.84■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 CCNDBP1O95273 360 aa25.83■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 ACSL3O95573 720 aa25.83■■□□□ 1.73
TPGS1-201ENST00000359315 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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