RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 KLRF1Q9NZS2 232 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 HSD11B1P28845 292 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 QSOX2Q6ZRP7 698 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 P2RX2Q9UBL9 471 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 WASF2Q9Y6W5 498 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 MID1O15344 667 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GBAP04062 536 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 EBF3Q9H4W6 596 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RPP14O95059 124 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GHRHRQ02643 423 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC66Q68CR7 880 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF599Q96NL3 588 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 AKTIPQ9H8T0 292 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TLR9Q9NR96 1032 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB9Q9UBS3 223 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PFDN2Q9UHV9 154 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINA3P01011 423 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TYRP14679 529 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SYVN1Q86TM6 617 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RB1P06400 928 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL22Q53GT1 634 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP40Q5TG30 622 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NTAN1Q96AB6 310 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SEC61A2Q9H9S3 476 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PDCD5O14737 125 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ECHS1P30084 290 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM164Q5U3C3 297 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 OR2AP1Q8NGE2 309 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SLC32A1Q9H598 525 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF3P17036 446 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K8P41279 467 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 AMBNQ9NP70 447 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ADAM8P78325 824 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NCSTNQ92542 709 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC115Q96NT0 180 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PKP4Q99569 1192 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD3Q9Y597 815 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 KMOO15229 486 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CBFA2T3O75081 653 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CD2P06729 351 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SLC11A1P49279 550 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 DGKQP52824 942 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 OXSMQ9NWU1 459 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CDC14AQ9UNH5 594 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 POMPQ9Y244 141 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CYP11A1P05108 521 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 PTNP21246 168 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFS1P28331 727 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 GDF5P43026 501 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CMTM7Q96FZ5 175 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM209Q96SK2 561 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A3Q9BRY0 314 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 MGAT4AQ9UM21 535 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 HOXB2P14652 356 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 GKP32189 559 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 IQCCQ4KMZ1 466 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A8Q8IWU4 369 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 NAT14Q8WUY8 206 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 DUXAA6NLW8 204 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SCDO00767 359 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TBX1O43435 398 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CHP2O43745 196 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 EDNRAP25101 427 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SCN1BQ07699 218 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 OSTM1Q86WC4 334 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TDP1Q9NUW8 608 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TAS2R7Q9NYW3 318 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 A8MT66 165 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 OR1I1O60431 355 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 EOGTQ5NDL2 527 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 BRAT1Q6PJG6 821 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 FABP12A6NFH5 140 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 PRPS1L1P21108 318 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CD47Q08722 323 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms