RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLTPP55058 493 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFKB2Q00653 900 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP140Q13342 867 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCF4Q15080 339 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGT8Q16880 541 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf189Q5VU69 101 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRA8Q7Z7C7 330 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A11Q86WA9 606 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPH7Q9BTV6 452 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLNQ9BYT8 704 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHACTR1Q9C0D0 580 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE10AQ9Y233 779 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLHQ9Y253 713 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWA7Q9Y334 891 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSTR1P30872 391 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA25Q14CX7 972 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHKG1Q16816 387 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICE2Q659A1 982 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf74Q6P047 294 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC14L1Q92503 715 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SELENOSQ9BQE4 189 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDC1Q9BTX1 674 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD5Q9NSY2 213 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKMY1Q9P2S6 941 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNMB2Q9Y691 235 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0J9YVX5 310 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9J4A7 227 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC16A5O15375 505 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIAS1O75925 651 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGXTP21549 392 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL2P60568 153 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC7A5Q01650 507 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAV1Q03135 178 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf57Q0VDD7 668 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNAB2Q13303 367 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTE1Q5JU00 501 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAQR7Q86WK9 346 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PALM2Q8IXS6 379 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCOLN3Q8TDD5 553 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCD4Q9BRC7 762 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARVBQ9HBI1 364 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCFL5Q9UL49 500 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX7Q9UNH6 387 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC88CQ9P219 2028 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCSK5Q92824 1860 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESYT3A0FGR9 886 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FITM1A5D6W6 292 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNDBP1O95273 360 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QAP02745 245 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGAXP20702 1163 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBPL1P62380 186 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCDP81605 110 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRM7Q14831 915 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC9A5Q14940 896 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF425Q6IV72 752 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM207Q6UWW9 146 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4N4Q8N0Y3 316 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF592Q92610 1267 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS39Q96JC1 886 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC138Q96M89 665 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC1Q9BTT6 524 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHOJQ9H4E5 214 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUTCQ9NTM9 273 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCF3Q9NUQ8 709 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GX78 115 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms