RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMPRSS11BQ86T26 416 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CDYL2Q8N8U2 506 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL6Q8TCB7 284 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRASLS2Q9NWW9 162 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF225Q9UK10 706 aa26.46■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa26.45■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EHD1Q9H4M9 534 aa26.45■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL14Q9P2G3 628 aa26.45■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TIMM22Q9Y584 194 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa26.45■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH4A1P30038 563 aa26.44■■□□□ 1.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA4P54764 986 aa26.44■■□□□ 1.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCCQ15814 346 aa26.44■■□□□ 1.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 CGB2Q6NT52 195 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB11Q9BUY7 163 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC29A3Q9BZD2 475 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 PELI2Q9HAT8 420 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH2B3Q9UQQ2 575 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPC5OSA6NMA1 111 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFS1O76024 890 aa26.44■■□□□ 1.82
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