RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ZUFSPQ96AP4 578 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 WDR34Q96EX3 536 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 BRF2Q9HAW0 419 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MCM8Q9UJA3 840 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 FZD4Q9ULV1 537 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SDC1P18827 310 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 KELP23276 732 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SPANXN4Q5MJ08 99 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR5AR1Q8NGP9 310 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CLHC1Q8NHS4 586 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 APOLD1Q96LR9 279 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LRGUKQ96M69 825 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM8Q9BZR9 551 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM15Q9C019 465 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 VPS29Q9UBQ0 182 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MBTPS2O43462 519 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 RPN2P04844 631 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PGRP06401 933 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 IGFALSP35858 605 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 GSK3BP49841 420 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRIP10Q15642 601 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SIPA1Q96FS4 1042 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CGREF1Q99674 301 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MUC13Q9H3R2 512 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ALG2Q9H553 416 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 KCNK12Q9HB15 430 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 KCNH1O95259 989 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 C7P10643 843 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ATP6V1B2P21281 511 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LIPEQ05469 1076 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 DMPKQ09013 629 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 IZUMO2Q6UXV1 221 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CYP2R1Q6VVX0 501 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SLC44A3Q8N4M1 653 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR7G3Q8NG95 312 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 EHD1Q9H4M9 534 aa25.93■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3EA0A087X179 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3LB9A6J9 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3HP0C7X1 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PEX2P28328 305 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LPCAT4Q643R3 524 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ATG9BQ674R7 924 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 NOXRED1Q6NXP6 359 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MED27Q6P2C8 311 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 USP30Q70CQ3 517 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM126BQ8IUX1 230 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PHC3Q8NDX5 983 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 REPS1Q96D71 796 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM74Q96NL1 305 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 RMI1Q9H9A7 625 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 RIMS3Q9UJD0 308 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ACSL5Q9ULC5 683 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TACR1P25103 407 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LCN8Q6JVE9 175 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OR5K2Q8NHB8 316 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SLC5A11Q8WWX8 675 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 GTF2H4Q92759 462 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TSSK3Q96PN8 268 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ECSITQ9BQ95 431 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL4Q9C0H6 718 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PI15O43692 258 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 SLC35G4P0C7Q5 338 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 CATSPEREQ5SY80 951 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 ASB12Q8WXK4 309 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TESCQ96BS2 214 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 PPM1MQ96MI6 270 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 TIMM29Q9BSF4 260 aa25.91■■□□□ 1.74
HOXD8-201ENST00000313173 LIMD1Q9UGP4 676 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms