RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 HLA-EP13747 358 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 KHKP50053 298 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 TMC8Q8IU68 726 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 KCT2Q8NC54 265 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 OR2T29Q8NH02 315 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SYT11Q9BT88 431 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 GALNT8Q9NY28 637 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CHST10O43529 356 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 STATHP02808 62 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RB1P06400 928 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SPIN4Q56A73 249 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 GPR151Q8TDV0 419 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 HPS1Q92902 700 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ARMC5Q96C12 935 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.66□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 S1PR4O95977 384 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 DSTNP60981 165 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SYT16Q17RD7 645 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 EMC10Q5UCC4 262 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 LRRC17Q8N6Y2 441 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 IL12RB2Q99665 862 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC106Q9BWC9 280 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ABCG4Q9H172 646 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 B3GALT2O43825 422 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CD1DP15813 335 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ARSDP51689 593 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 MTTPP55157 894 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CYS1Q717R9 158 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 OXR1Q8N573 874 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SMPDL3AQ92484 453 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 CD244Q9BZW8 370 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF222Q9UK12 451 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 HSD17B2P37059 387 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 NFATC2Q13469 925 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM74Q86UV6 250 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 BPIFB1Q8TDL5 484 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SNX33Q8WV41 574 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 PKP4Q99569 1192 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 OR51V1Q9H2C8 321 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 MKS1Q9NXB0 559 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 DHRS7Q9Y394 339 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 LDB2O43679 373 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 EDN1P05305 212 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 FSHRP23945 695 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 AVPR1BP47901 424 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 ABHD18Q0P651 414 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 SLC13A2Q13183 592 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 IL18Q14116 193 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 RPTNQ6XPR3 784 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 LRCH3Q96II8 777 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 EDIL3O43854 480 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.65□□□□□ -0.86
TMOD3-201ENST00000308580 MYO9BQ13459 2157 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 CYP11A1P05108 521 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM32Q13049 653 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 RTP2Q5QGT7 225 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 RFKQ969G6 155 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 TRBC2A0A5B9 178 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 AXIN1O15169 862 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 CREG1O75629 220 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 SLC38A3Q99624 504 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.65□□□□□ -0.87
TMOD3-201ENST00000308580 KCNK6Q9Y257 313 aa9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms