RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FRMPD3Q5JV73 1810 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GVM2 712 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF15O94989 841 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PRPS2P11908 318 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ATF6P18850 670 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SERPINB1P30740 379 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LIPAP38571 399 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 GPR17Q13304 367 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 NFATC2Q13469 925 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CHST9Q7L1S5 443 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PGBD3Q8N328 593 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLC38A4Q969I6 547 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PITX2Q99697 317 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ITPAQ9BY32 194 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RDH14Q9HBH5 336 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 E9PQ18 207 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 EOMESO95936 686 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PPP3CCP48454 512 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SYT16Q17RD7 645 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 VMACQ2NL98 169 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PRSS36Q5K4E3 855 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 HTRA1Q92743 480 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 DNASE1L2Q92874 299 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 APIPQ96GX9 242 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 HHIPQ96QV1 700 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 METTL15A6NJ78 407 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 EVPLLA8MZ36 301 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KCNK5O95279 499 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ASGR1P07306 291 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ACRV1P26436 265 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KDELR2P33947 212 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 NPRL3Q12980 569 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ZNF404Q494X3 552 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 COLEC12Q5KU26 742 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FAHD1Q6P587 224 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 GKN1Q9NS71 199 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 VPS51Q9UID3 782 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.5□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ISPDA4D126 451 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 M0R082 166 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CLIC1O00299 241 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 AOC2O75106 756 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ENGP17813 658 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 UGT2B10P36537 528 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 RHOAP61586 193 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PTOV1Q86YD1 416 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 MYO19Q96H55 970 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ABCG8Q9H221 673 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 MMP27Q9H306 513 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 SLC32A1Q9H598 525 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 IL26Q9NPH9 171 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 COCHO43405 550 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TBX1O43435 398 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 AIREO43918 545 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 STC2O76061 302 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 PGLSO95336 258 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ITGALP20701 1170 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 GSSP48637 474 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TUBA1BP68363 451 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 FAM26DQ5JW98 314 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 STEAP3Q658P3 488 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 MACC1Q6ZN28 852 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 TUBA1AQ71U36 451 aa14.49□□□□□ -0.09
SYP-201ENST00000263233 CBLL1Q75N03 491 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms