RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM74Q86UV6 250 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF583Q96ND8 569 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 EHD1Q9H4M9 534 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ADH1BP00325 375 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 C7P10643 843 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 TEAD1P28347 426 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 MTAPQ13126 283 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SELPLGQ14242 412 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF480Q8WV37 535 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 CHFRQ96EP1 664 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 APOLD1Q96LR9 279 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SGPP1Q9BX95 441 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 KLHL33A6NCF5 533 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ANXA6P08133 673 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 CDH1P12830 882 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ACADLP28330 430 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 OXTRP30559 389 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 POLE2P56282 527 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 PRKCQQ04759 706 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 PNCKQ6P2M8 343 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 OR2T12Q8NG77 320 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 BIRC7Q96CA5 298 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SERHLQ9NQF3 203 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 EYSQ5T1H1 3165 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 EPOPA6NHQ4 379 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 MYO1DO94832 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 GPR89BP0CG08 455 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 DRD3P35462 400 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 CCT8P50990 548 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 GPR180Q86V85 440 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 MSRB3Q8IXL7 192 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 DTWD1Q8N5C7 304 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 NUDT8Q8WV74 236 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 TSSK3Q96PN8 268 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 MYADMQ96S97 322 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SGK2Q9HBY8 427 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD9-201ENST00000249499 NCK1P16333 377 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 C5AR1P21730 350 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TACR1P25103 407 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TBPL1P62380 186 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 HYAL1Q12794 435 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CST6Q15828 149 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ATP6AP1Q15904 470 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 MFSD2AQ8NA29 543 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FOXJ1Q92949 421 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CIB1Q99828 191 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DYRK1BQ9Y463 629 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TNFRSF4P43489 277 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 KIR3DL1P43629 444 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TRPC1P48995 793 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PHC1P78364 1004 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SPIN4Q56A73 249 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 AGBL4Q5VU57 503 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 MED27Q6P2C8 311 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 GBP5Q96PP8 586 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PPT2Q9UMR5 302 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 C7orf72A4D263 438 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms