RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 DENND4CQ5VZ89 1909 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CBFA2T3O75081 653 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 B3GALT4O96024 378 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CYP4F8P98187 520 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 IL5RAQ01344 420 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ABRQ12979 859 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 MTAPQ13126 283 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CDK5R2Q13319 367 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 FKBP10Q96AY3 582 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF558Q96NG5 402 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PANX1Q96RD7 426 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 GFYI3L273 518 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 KPNA5O15131 536 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HALP42357 657 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PRMT2P55345 433 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PIGFQ07326 219 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 DUOXA1Q1HG43 343 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 OR2T5Q6IEZ7 315 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CRTC3Q6UUV7 619 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PGBD3Q8N328 593 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 OR2T29Q8NH02 315 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 M0QX08 132 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CLIC1O00299 241 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 FTH1P02794 183 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 JUPP14923 745 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PCMT1P22061 227 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SPINT3P49223 89 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC7A9P82251 487 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC14A1Q13336 389 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 RAPSNQ13702 412 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 GTF2H3Q13889 308 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SYT12Q8IV01 421 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 VRK3Q8IV63 474 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 FPGTO14772 594 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PRMT3O60678 531 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ANGPTL1O95841 491 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ITPKAP23677 461 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HTR1BP28222 390 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF33BQ06732 778 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CHIT1Q13231 466 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGEF6Q15052 776 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 VMACQ2NL98 169 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 GAREM2Q75VX8 874 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CYP4Z1Q86W10 505 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 BRD9Q9H8M2 597 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ENPP5Q9UJA9 477 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 MAFFQ9ULX9 164 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 UGDHO60701 494 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 EPN2O95208 641 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 C1SP09871 688 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 TFPTP0C1Z6 253 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ENGP17813 658 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 KEAP1Q14145 624 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CARD16Q5EG05 197 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms