RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PLCL2Q9UPR0 1127 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.4■■□□□ 1.02
SYF2-201ENST00000236273 TERTO14746 1132 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K7O43318 606 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RIPK2O43353 540 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SCRG1O75711 98 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ABHD2P08910 425 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2ADP20671 130 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GCAP28676 217 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GCGRP47871 477 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 KCNC1P48547 511 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PMS2P54278 862 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TBPL1P62380 186 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 NAE1Q13564 534 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR56A3Q8NH54 315 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PTERQ96BW5 349 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FBXL8Q96CD0 374 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PAFAH2Q99487 392 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PRORYQ9H606 182 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CPNE5Q9HCH3 593 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ARL15Q9NXU5 204 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.39■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GUCA1CO95843 209 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 F8A1P23610 371 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CMPK1P30085 196 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RORAP35398 523 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ITGA1P56199 1179 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ABHD18Q0P651 414 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 GPS2Q13227 327 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PAQR7Q86WK9 346 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ESX1Q8N693 406 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR4K3Q96R72 315 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 DHRS4Q9BTZ2 278 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FANCEQ9HB96 536 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 IGSF5Q9NSI5 407 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OARD1Q9Y530 152 aa21.38■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZNF749O43361 778 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 KRT37O76014 449 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 NPPBP16860 134 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CRABP2P29373 138 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 STAT5AP42229 794 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ATP1A2P50993 1020 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CDKL1Q00532 357 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR4D1Q15615 310 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LCN10Q6JVE6 187 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 RNF44Q7L0R7 432 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PYCR2Q96C36 320 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LRFN5Q96NI6 719 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LHX9Q9NQ69 397 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.37■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 E7EQ34 232 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 K7ENP7 123 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 OR2B3O76000 313 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 C2P06681 752 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 LIFP15018 202 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA12P43365 314 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ABATP80404 500 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CSHL1Q14406 222 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SLC29A2Q14542 456 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 MANEAQ5SRI9 462 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 BROXQ5VW32 411 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ISCA2Q86U28 154 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ISL2Q96A47 359 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 SNX15Q9NRS6 342 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.36■■□□□ 1.01
SYF2-201ENST00000236273 ANKMY1Q9P2S6 941 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms