RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ldoc1Q7TPY9 151 aa10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otop2Q80SX5 563 aa10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grhl2Q8K5C0 625 aa10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Batf3Q9D275 118 aa10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Jph1Q9ET80 660 aa10.7□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm28363A0A087WQW2 129 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp3r1Q63810 170 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fstl5Q8BFR2 847 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sephs1Q8BH69 392 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf410Q8BKX7 478 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lars2Q8VDC0 902 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cpxm2Q9D2L5 764 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccnb1ip1D3Z3K2 276 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Unc5cO08747 931 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sema6aO35464 1031 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vav1P27870 845 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FhP97807 507 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smu1Q3UKJ7 513 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clca4bQ3UW98 925 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clhc1Q5M6W3 596 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SargQ8BI29 606 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GatcQ8CBY0 155 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klk6Q91Y82 253 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mospd2Q9CWP6 518 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cmtm8Q9CZR4 173 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnajb9Q9QYI6 222 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Med20Q9R0X0 212 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tet3Q8BG87 1668 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm11758A2BEI6 360 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm11757A2BEI8 360 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Chrna9G3X8Z7 479 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bnip2O54940 326 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scg5P12961 212 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MaxP28574 160 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Impdh1P50096 514 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GstcdQ5RL51 634 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rabl6Q5U3K5 725 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il1rapQ61730 570 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syt14Q7TN84 555 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr667Q7TRP4 326 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam181bQ80VF6 417 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q810N5 247 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnk10Q8BUW1 535 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Peli3Q8BXR6 445 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NaprtQ8CC86 538 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tab1Q8CF89 502 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Phc3Q8CHP6 981 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MepceQ8K3A9 666 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AvenQ9D9K3 342 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc34a2Q9DBP0 697 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eif3kQ9DBZ5 218 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rab13Q9DD03 202 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smim24Q0VG18 120 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Eef2kmtQ3UZW7 335 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtprnQ60673 979 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P4ha2Q60716 537 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trpv1Q704Y3 839 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnajc16Q80TN4 772 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BspryQ80YW5 473 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gemin8Q8BHE1 238 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ift80Q8K057 777 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr677Q8VF06 312 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930519G04RikQ9CPT7 205 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PlgrktQ9D3P8 147 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Khdrbs3Q9R226 346 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa10.69□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wdr76A6PWY4 622 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21897J3KMP5 500 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10721J3QPJ9 223 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Matn2O08746 956 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syn1O88935 706 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 mt-Co3P00416 261 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01650 108 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01653 108 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prf1P10820 554 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Magee2Q52KG3 523 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav8d-2Q5R1B6 112 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp189Q8BKP2 608 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mettl6Q8BVH9 282 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Foxe1Q8R2I0 371 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ccdc71Q8VEG0 433 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr818Q8VG46 318 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcyt2Q922E4 404 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dok4Q99KE3 325 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Elovl2Q9JLJ4 292 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PigqQ9QYT7 581 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930455H04RikD3Z622 58 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdcd5P56812 126 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pip5k1bP70181 539 aa10.68□□□□□ -0.7
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 WasP70315 520 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27 ms