RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AGAP5	A6NIR3	686 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC4A1	P02730	911 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RAP2A	P10114	183 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GLRB	P48167	497 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GSK3B	P49841	420 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STC1	P52823	247 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GEN1	Q17RS7	908 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF404	Q494X3	552 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STEAP3	Q658P3	488 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DESI1	Q6ICB0	168 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EGLN2	Q96KS0	407 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD2	Q9BX70	525 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C3orf18	Q9UK00	162 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GBF1	Q92538	1859 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HAT1	O14929	419 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SOCS5	O75159	536 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	VPS4B	O75351	444 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	INMT	O95050	263 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RBP1	P09455	135 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TYR	P14679	529 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL7R	P16871	459 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN2D	P55273	166 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRR	Q15256	657 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SETD9	Q8NE22	299 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf60	Q96EN9	201 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TOR3A	Q9H497	397 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MKLN1	Q9UL63	735 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MFN2	O95140	757 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRSS56	P0CW18	603 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CTPS1	P17812	591 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FDXR	P22570	491 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CXCR4	P61073	352 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CSHL1	Q14406	222 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DMC1	Q14565	340 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SIX5	Q8N196	739 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ITFG1	Q8TB96	612 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CERS4	Q9HA82	394 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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