RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 C21orf59P57076 290 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHG6Q3KR16 790 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TPGS2Q68CL5 300 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 DCDC5Q6ZRR9 648 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 GAREM2Q75VX8 874 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 L3MBTL4Q8NA19 623 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ASB11Q8WXH4 323 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 VWCEQ96DN2 955 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 FCRL1Q96LA6 429 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SLC12A9Q9BXP2 914 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CD84Q9UIB8 345 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CLPXO76031 633 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 KRT6AP02538 564 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 FUCA1P04066 466 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 KRT6BP04259 564 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CYP4B1P13584 511 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ITIH1P19827 911 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 EPHA2P29317 976 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 RYKP34925 604 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 KRT6CP48668 564 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CRYBA2P53672 197 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 EPS8Q12929 822 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 UGT8Q16880 541 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PTOV1Q86YD1 416 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF566Q969W8 418 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SCRN2Q96FV2 425 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 APOLD1Q96LR9 279 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.98□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 DOCK6Q96HP0 2047 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 NPIPB8E9PQR5 432 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PITPNM1O00562 1244 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 BCKDKO14874 412 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SGTAO43765 313 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MTX2O75431 263 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF15O94989 841 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ITPKAP23677 461 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 HOXA9P31269 272 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 IDUAP35475 653 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD18Q0P651 414 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MTAPQ13126 283 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 FKBP9P1Q75LS8 142 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 VTCN1Q7Z7D3 282 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ZZZ3Q8IYH5 903 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CMTM7Q96FZ5 175 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf18Q9UK00 162 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SLC22A14Q9Y267 594 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PTGES3LE9PB15 166 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 E2F6O75461 281 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SULT1C4O75897 302 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 IGSF6O95976 241 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 BCL10O95999 233 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PPP3CCP48454 512 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 VLDLRP98155 873 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 KCNC4Q03721 635 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 HSPA14Q0VDF9 509 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL9Q3SXZ7 439 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ADNP2Q6IQ32 1131 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TPRG1Q6ZUI0 275 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ABHD11Q8NFV4 315 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 COPS8Q99627 209 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ELOVL6Q9H5J4 265 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D23Q9NUY8 699 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SIRT5Q9NXA8 310 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 ERVK-18Q9QC07 812 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.97□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PRRG1O14668 218 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 NUAK1O60285 661 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 CXCL10P02778 98 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PRPS2P11908 318 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINA4P29622 427 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 FMO3P31513 532 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 OPRL1P41146 370 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MAP2K4P45985 399 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 MASP1P48740 699 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 PFN3P60673 137 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 VEPH1Q14D04 833 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 IQCCQ4KMZ1 466 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB128Q7Z7B8 93 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 NODALQ96S42 347 aa12.96□□□□□ -0.33
C9orf170-201ENST00000623052 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms