RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.96■□□□□ 0.95
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SGMS1-210ENST00000619438 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SGMS1-210ENST00000619438 PKNOX1P55347 436 aa20.92■□□□□ 0.94
SGMS1-210ENST00000619438 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.943e-9■■■■■ 47.4
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SGMS1-210ENST00000619438 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SGMS1-210ENST00000619438 IRGCQ6NXR0 463 aa20.92■□□□□ 0.94
SGMS1-210ENST00000619438 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
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