RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RBP5	P82980	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NR1D2	Q14995	579 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZACN	Q401N2	412 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RAD54L	Q92698	747 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	AK8	Q96MA6	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SEC16A	O15027	2179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768		K7ENM7	598 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC19A2	O60779	497 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	UBXN7	O94888	489 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	BMP15	O95972	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TNF	P01375	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PIGR	P01833	764 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TPO	P07202	933 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PDHA1	P08559	390 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	BRAF	P15056	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ADORA2B	P29275	332 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CHRNA3	P32297	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK9	P45984	424 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CASP5	P51878	434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NEK3	P51956	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CASP6	P55212	293 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	YPEL5	P62699	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DLG2	Q15700	870 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MIDN	Q504T8	468 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NR4A3	Q92570	626 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MYO1C	O00159	1063 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	QSOX1	O00391	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SPTLC2	O15270	562 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ALOX15B	O15296	676 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZW10	O43264	779 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SPAG6	O75602	509 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TUSC2	O75896	110 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	WISP2	O76076	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	YEATS4	O95619	227 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ADRB3	P13945	408 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CD19	P15391	556 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MST1	P26927	711 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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