RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOXC2Q99958 501 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A8MUI8 341 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RASGRF2O14827 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.071e-7■□□□□ 8.7
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANXA9O76027 345 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FTH1P02794 183 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ERVK-10P10266 1014 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKLRP30613 574 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OLIG2Q13516 323 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TFDP2Q14188 446 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MUM1Q2TAK8 710 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GHDCQ8N2G8 530 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 APOL2Q9BQE5 337 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KLHL1Q9NR64 748 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FBN3Q75N90 2809 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A1W2PQ72 361 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RCCD1A6NED2 376 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCL22O00626 93 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASNA1O43681 348 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPN2P04844 631 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD9P21926 228 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 P3H4Q92791 437 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C19orf43Q9BQ61 176 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 A0A0J9YVX5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CST8O60676 142 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZWINTO95229 277 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNNT1P13805 278 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CD46P15529 392 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FOLH1Q04609 750 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYBPHQ13203 477 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KAZNQ674X7 775 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RANBP10Q6VN20 620 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRGNQ92686 78 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CABS1Q96KC9 395 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GBA3Q9H227 469 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TARM1B6A8C7 271 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLCO2B1O94956 709 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FKBP9O95302 570 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MED26O95402 600 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR56A5P0C7T3 313 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRSS56P0CW18 603 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DSG2Q14126 1118 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRPSAP1Q14558 356 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PCOLCEQ15113 449 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FIGNQ5HY92 759 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BEST3Q8N1M1 668 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.61□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ASB5Q8WWX0 329 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms