RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD4-208ENST00000597315 NDOR1Q9UHB4 597 aa25.86■■□□□ 1.73
BRD4-208ENST00000597315 TAC3Q9UHF0 121 aa25.86■■□□□ 1.73
BRD4-208ENST00000597315 PADI2Q9Y2J8 665 aa25.86■■□□□ 1.73
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