RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 CES5AQ6NT32 575 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 TMC8Q8IU68 726 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GPR65Q8IYL9 337 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CHPFQ8IZ52 775 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PGBD3Q8N328 593 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ARL10Q8N8L6 244 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 NELL1Q92832 810 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 APIPQ96GX9 242 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ABCG8Q9H221 673 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CARNS1A5YM72 827 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 EVPLLA8MZ36 301 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 UGDHO60701 494 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ITGAMP11215 1152 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 JUPP14923 745 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HLA-FP30511 346 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CDKN2CP42773 168 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 KIR3DL1P43629 444 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MEP1AQ16819 746 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DET1Q7L5Y6 550 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ANKRD46Q86W74 232 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 VRK3Q8IV63 474 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 BORCS5Q969J3 196 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LHPPQ9H008 270 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.85□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LEFTY2O00292 366 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GRM6O15303 877 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 UGT2B4P06133 528 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 INHBBP09529 407 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 RANBP1P43487 201 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 KCNC3Q14003 757 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CPZQ66K79 652 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CAPNS2Q96L46 248 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 APOLD1Q96LR9 279 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 BNIP3LO60238 219 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PRAMEF4O60810 478 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HTR1AP08908 422 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC159P0C7I6 412 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PFKLP17858 780 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PRMT2P55345 433 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CREMQ03060 361 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LIPJQ5W064 366 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 DOK6Q6PKX4 331 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CYP2U1Q7Z449 544 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HS6ST3Q8IZP7 471 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF566Q969W8 418 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PYCR2Q96C36 320 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 PSME2Q9UL46 239 aa14.84□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CFAP99D6REC4 459 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 SLC1A7O00341 560 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LILRB3O75022 631 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF30P17039 623 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CD247P20963 164 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 MOGQ16653 247 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 FBXL8Q96CD0 374 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC138Q96M89 665 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.83□□□□□ -0.03
HDAC5-211ENST00000592385 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms