RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4F6Q8NGB9 312 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52B6Q8NGF0 335 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T11Q8NH01 316 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FBRSQ9HAH7 460 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 QSOX1O00391 747 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR39O43194 453 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS14O43566 566 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GNSP15586 552 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 JAK1P23458 1154 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GKP32189 559 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TLR1Q15399 786 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TRIM46Q7Z4K8 759 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TSPAN33Q86UF1 283 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FNDC5Q8NAU1 212 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 WWOXQ9NZC7 414 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 AP3M1Q9Y2T2 418 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB1Q9Y576 335 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0U1RQS6 177 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GPIP06744 558 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA5P08758 320 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 UMPSP11172 480 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CD59P13987 128 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 STK19P49842 368 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 NFYCQ13952 458 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC36Q1X8D7 754 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 IL23RQ5VWK5 629 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SFRP1Q8N474 314 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PACRGLQ8N7B6 248 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM125Q96AQ2 219 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHAC1Q9H158 963 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP2Q9UG22 337 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GTW7 788 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM1O15116 133 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LINGO3P0C6S8 592 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 BMP2P12643 396 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSL1P33121 698 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CA5AP35218 305 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 HNMTP50135 292 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RALGDSQ12967 914 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PDK3Q15120 406 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LAYNQ6UX15 382 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 HDDC3Q8N4P3 179 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKFN1Q8N957 763 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC45A3Q96JT2 553 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 EGFL8Q99944 293 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 HEPHQ9BQS7 1158 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM79Q9BSE2 394 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 MTG2Q9H4K7 406 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC32A1Q9H598 525 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CMTM6Q9NX76 183 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 DKK3Q9UBP4 350 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL27Q9Y4X3 112 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP99D6REC4 459 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 NPIPB8E9PQR5 432 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ASLP04424 464 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 C1SP09871 688 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FCGR1AP12314 374 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 EPB42P16452 691 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 LHCGRP22888 699 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 AOAHP28039 575 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 VIPR1P32241 457 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 CHN2P52757 468 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF33BQ06732 778 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM124AQ86V42 546 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJB8Q8NHS0 232 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 PROKR1Q8TCW9 393 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 BPTFQ12830 3046 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 SERTM1A2A2V5 107 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 STK16O75716 305 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR1EP28566 365 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms