RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 LCA5Q86VQ0 697 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 KMT5CQ86Y97 462 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 WBP1Q96G27 269 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PARVBQ9HBI1 364 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 TLCD2A6NGC4 264 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 C2orf74A8MZ97 194 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 CDH16O75309 829 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PRB1P04280 392 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 COL6A2P12110 1019 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 CD1DP15813 335 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2ADP20671 130 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 SAT1P21673 171 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 TYK2P29597 1187 aa9.55□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 BDKRB1P46663 353 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF460Q14592 562 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.55□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 TTC36A6NLP5 189 aa9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 C2P06681 752 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 MSL3P1P0C860 447 aa9.54□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 CCND1P24385 295 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ATP1A2P50993 1020 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 BMPR2Q13873 1038 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 NAA25Q14CX7 972 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.54□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.54□□□□□ -0.88
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