RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2B3	O76000	313 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCN2	P20062	427 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MAG	P20916	626 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RGS4	P49798	205 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDKN2D	P55273	166 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPS2	Q13227	327 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2L3	Q8NG85	312 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	EXTL1	Q92935	676 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	KRT87P	A6NCN2	255 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC16A5	O15375	505 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	NKX2-8	O15522	239 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF749	O43361	778 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	HCRTR1	O43613	425 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC16A8	O95907	504 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	C8G	P07360	202 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCM3	P25205	808 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTPN4	P29074	926 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRIA3	P42263	894 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYP4F2	P78329	520 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	NFKB2	Q00653	900 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDC20	Q12834	499 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SP140	Q13342	867 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TBR1	Q16650	682 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PKP4	Q99569	1192 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	EURL	Q9NYK6	297 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CREG1	O75629	220 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	GSTA2	P09210	222 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	FDXR	P22570	491 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLTP	P55058	493 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	IL2	P60568	153 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	TLE1	Q04724	770 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF480	Q8WV37	535 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MR1	Q95460	341 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CSNK1D-208	ENST00000578501		E7ENX8	843 aa		13.09	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms