RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DEFB119Q8N690 84 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 GPR156Q8NFN8 814 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 STON2Q8WXE9 905 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 APIPQ96GX9 242 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 EGLN2Q96KS0 407 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CCT7Q99832 543 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 APOOQ9BUR5 198 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TPSD1Q9BZJ3 242 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SGK2Q9HBY8 427 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MRGBPQ9NV56 204 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CCL27Q9Y4X3 112 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PRORSD1PA6NEY8 169 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SHISA7A6NL88 538 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SLC28A1O00337 649 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 AKAP10O43572 662 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DNAJA2O60884 412 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ANP32DO95626 131 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 GBAP04062 536 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NPPBP16860 134 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TACR1P25103 407 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TDGQ13569 410 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 METRNLQ641Q3 311 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 KBTBD6Q86V97 674 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SNX19Q92543 992 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PDXPQ96GD0 296 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ACTL8Q9H568 366 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 C1orf109Q9NX04 203 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 EBF1Q9UH73 591 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 INVSQ9Y283 1065 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FOSL2P15408 326 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ME2P23368 584 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PSMB5P28074 263 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PIGGQ5H8A4 983 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RABL3Q5HYI8 236 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CACHD1Q5VU97 1274 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PDZD3Q86UT5 571 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DNASE1L2Q92874 299 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 USP7Q93009 1102 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PPM1MQ96MI6 270 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 HHIPQ96QV1 700 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 DPY30Q9C005 99 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 NDE1Q9NXR1 346 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TAC3Q9UHF0 121 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PP18 115 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TGFB1P01137 390 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 BCKDHAP12694 445 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 JUPP14923 745 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ATP4BP51164 291 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PNLIPRP1P54315 467 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 RCAN2Q14206 197 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FBXO43Q4G163 708 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ADCK2Q7Z695 626 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 SPATA24Q86W54 205 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 ANKRD46Q86W74 232 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 OR7G3Q8NG95 312 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 OR56A3Q8NH54 315 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 LRRC58Q96CX6 371 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 TMEM74Q96NL1 305 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CS-215ENST00000549143 FOXQ1Q9C009 403 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms