RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OR6C4Q8NGE1 309 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 OR56A4Q8NGH8 313 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 MOSPD2Q8NHP6 518 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 METTL6Q8TCB7 284 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PHF21BQ96EK2 531 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 LIPMQ5VYY2 423 aa5.92□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 COL19A1Q14993 1142 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.92□□□□□ -1.46
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