RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	YPEL5	P62699	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBB4B	P68371	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ADAM8	P78325	824 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ARF5	P84085	180 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MYL5	Q02045	173 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DOC2A	Q14183	400 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF234	Q14588	700 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HFE	Q30201	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM215	Q68D42	235 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CORO6	Q6QEF8	472 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RDM1	Q8NG50	284 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	METTL6	Q8TCB7	284 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TCP11	Q8WWU5	503 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC45	Q96CN5	670 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SH3GL2	Q99962	352 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GAL3ST1	Q99999	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ERP44	Q9BS26	406 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX12	Q9BXU0	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LHX5	Q9H2C1	402 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	IL20	Q9NYY1	176 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PSME2	Q9UL46	239 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPT1	Q9Y234	373 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HPSE	Q9Y251	543 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1W2PQM1	296 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CPED1	A4D0V7	1026 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRD1	A4D1F6	860 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF212B	A8MTL3	300 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	C19orf84	I3L1E1	186 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MATN2	O00339	956 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPK13	O15264	365 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	VEGFD	O43915	354 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MYBL1	P10243	752 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CPT2	P23786	658 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP2F1	P24903	491 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PTAFR	P25105	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCR1	P32246	355 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEA4	P43358	317 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CAPZA2	P47755	286 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	IST1	P53990	364 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP9	P55211	416 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OSTN	P61366	133 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMC5	P62195	406 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DSC2	Q02487	901 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ELP6	Q0PNE2	266 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	IL10RA	Q13651	578 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PDK1	Q15118	436 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC23B	Q15437	767 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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