RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NCEH1Q6PIU2 408 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SASS6Q6UVJ0 657 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TRABD2AQ86V40 505 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PARGQ86W56 976 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 HORMAD1Q86X24 394 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ABCA7Q8IZY2 2146 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ARL14Q8N4G2 192 aa4.2□□□□□ -1.74
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HDAC2-216ENST00000523628 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NEK11Q8NG66 645 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 OR4C6Q8NH72 309 aa4.2□□□□□ -1.74
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HDAC2-216ENST00000523628 UBA3Q8TBC4 463 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NSMCE1Q8WV22 266 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 RLN3Q8WXF3 142 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TCEAL3Q969E4 200 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF599Q96NL3 588 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NPY6RQ99463 290 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 BPIFA3Q9BQP9 254 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 STRADBQ9C0K7 418 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CLSTN2Q9H4D0 955 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 KCNK9Q9NPC2 374 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PLK2Q9NYY3 685 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SPASTQ9UBP0 616 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CYTH4Q9UIA0 394 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ACACAQ13085 2346 aa4.2□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 IGF2RP11717 2491 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ATG2BQ96BY7 2078 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM49BA6NDI0 452 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP42A6NI28 874 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CGB1A6NKQ9 187 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 KCNJ18B7U540 433 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf142B7Z368 130 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 F8VZ95 297 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PSMD11O00231 422 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CES2O00748 559 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SCAMP1O15126 338 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MDM4O15151 490 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MID1O15344 667 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SH3BP5O60239 455 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SOCS5O75159 536 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV4-34P06331 123 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TPM1P09493 284 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 EBLN1P0CF75 366 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 GPR89BP0CG08 455 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 KRT3P12035 628 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 GZMAP12544 262 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 DRD4P21917 467 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 MMP8P22894 467 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PON1P27169 355 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TEAD1P28347 426 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINA4P29622 427 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNA3P32297 505 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CD70P32970 193 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ACSL1P33121 698 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 PSMD8P48556 350 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 HCAR3P49019 387 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 SULT1E1P49888 294 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 THOP1P52888 689 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ARL4CP56559 192 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 TMPRSS3P57727 454 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 FOXL2P58012 376 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CDR2Q01850 454 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 LRMPQ12912 555 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 NME3Q13232 169 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 DLG2Q15700 870 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 STX1AQ16623 288 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 KIF19Q2TAC6 998 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.19□□□□□ -1.74
HDAC2-216ENST00000523628 CARD16Q5EG05 197 aa4.19□□□□□ -1.74
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