RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 AGKQ53H12 422 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PYCR3Q53H96 274 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM198Q66K66 360 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 Q6ZSR9 355 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TRIM74Q86UV6 250 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SNX32Q86XE0 403 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GJD3Q8N144 294 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 UBE2E3Q969T4 207 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ROPN1LQ96C74 230 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 WDR34Q96EX3 536 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KCNA7Q96RP8 456 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PKP4Q99569 1192 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HAUS8Q9BT25 410 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SGPP1Q9BX95 441 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LGR4Q9BXB1 951 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 OSBPL6Q9BZF3 934 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 BRF2Q9HAW0 419 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 WASH6PQ9NQA3 447 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 AIG1Q9NVV5 245 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 BCAP29Q9UHQ4 241 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NDUFAF1Q9Y375 327 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.29□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 A0A1B0GTL3 188 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRR19A6NJB7 356 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 LSM1O15116 133 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC31A1O15431 190 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NRP2O60462 931 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PEX11AO75192 247 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC22A3O75751 556 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 SLC16A8O95907 504 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ERGP11308 486 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRPS2P11908 318 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 EPORP19235 508 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CXCR2P25025 360 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 NDUFS1P28331 727 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IMPA1P29218 277 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ACSL1P33121 698 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 IGFALSP35858 605 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HALP42357 657 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 RABIFP47224 123 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 POU4F2Q12837 409 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CHIT1Q13231 466 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 PRKG2Q13237 762 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CUL3Q13618 768 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GRB7Q14451 532 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CYP2A13Q16696 494 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 MMEL1Q495T6 779 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 FRG2Q64ET8 278 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 ATG9BQ674R7 924 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.28□□□□□ -1.24
SEC31A-241ENST00000515749 GRHL2Q6ISB3 625 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms