RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 SLC23A2Q9UGH3 650 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 GRID1Q9ULK0 1009 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TENM4Q6N022 2769 aa11.01□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 A6NCN8 305 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 NKX2-8O15522 239 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 GLRA3O75311 464 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 STK17BO94768 372 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CCNFP41002 786 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 EPHA4P54764 986 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TLE1Q04724 770 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CSHL1Q14406 222 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 NFE2L1Q14494 772 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 GBX1Q14549 363 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF460Q14592 562 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ACSBG2Q5FVE4 666 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM207Q6UWW9 146 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SLC22A15Q8IZD6 547 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 C4orf33Q8N1A6 199 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 RNF31Q96EP0 1072 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 LINGO1Q96FE5 620 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SLC45A3Q96JT2 553 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CATSPER2Q96P56 530 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SLC30A3Q99726 388 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ZPBPQ9BS86 351 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 DERL2Q9GZP9 239 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO8Q9NRD0 319 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CPNE7Q9UBL6 633 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 OR5K4A6NMS3 321 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PDZK1P1A8MUH7 402 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 VIPP01282 170 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 RBP1P09455 135 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 BRAFP15056 766 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CRHR1P34998 444 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 HALP42357 657 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PREPP48147 710 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PGGT1BP53609 377 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 GFERP55789 205 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 FOXM1Q08050 763 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CDC20Q12834 499 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ACAP2Q15057 778 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TTMPQ5BVD1 217 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf46Q6P387 395 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 WASH2PQ6VEQ5 465 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 NAPRTQ6XQN6 538 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 BANPQ8N9N5 519 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 AVL9Q8NBF6 648 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 STAG3L4Q8TBR4 150 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD49Q8WVL7 239 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 NXNL1Q96CM4 212 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 APOPT1Q96IL0 206 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SCYL1Q96KG9 808 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 EFHD1Q9BUP0 239 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SPRY4Q9C004 299 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 WASH6PQ9NQA3 447 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 MKS1Q9NXB0 559 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CDYLQ9Y232 598 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 UNC13CQ8NB66 2214 aa10.99□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 LILRA5A6NI73 299 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 SLC16A5O15375 505 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB14O43829 449 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 RPN2P04844 631 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 C8GP07360 202 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 CD1DP15813 335 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 TYRP1P17643 537 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 AMD1P17707 334 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 PDHA2P29803 388 aa10.98□□□□□ -0.65
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms