RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMPDL3AQ92484 453 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNJ9Q92806 393 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FKBP10Q96AY3 582 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM136AQ96C01 138 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIPEPQ99797 713 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FITM1A5D6W6 292 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO1CO00159 1063 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSCR3O14972 297 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF185O15231 689 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERGP11308 486 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CMPK1P30085 196 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTBP1Q13363 440 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OVCH1Q7RTY7 1134 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCGF5Q86SE9 256 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRGPREQ86SM8 312 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLCO2A1Q92959 643 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAT9Q9BTE0 207 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR54Q9H977 334 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CUTCQ9NTM9 273 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR83Q9NYM4 423 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GALPQ9UBC7 116 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHRS7Q9Y394 339 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1W2PPV9 198 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPM1O60762 260 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CTSVO60911 334 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC4O95801 387 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTK6Q13882 451 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGFBP7Q16270 282 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF10Q5QP82 559 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATCAYQ86WG3 371 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASB11Q8WXH4 323 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INPP5DQ92835 1189 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C5AR2Q9P296 337 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HYKKA2RU49 373 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2A25A4D2G3 310 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A6NL46 340 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTLL8A6PVC2 850 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB14O43829 449 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCNDBP1O95273 360 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MPC1LP0DKB6 136 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PGAM1P18669 254 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMB5P28074 263 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC1A2P43004 574 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD97P48960 835 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EMP3P54852 163 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9A5Q14940 896 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIB2Q96AX9 1013 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PKP4Q99569 1192 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DPH7Q9BTV6 452 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MED16Q9Y2X0 877 aa14.49□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRT87PA6NCN2 255 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GFYI3L273 518 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 VPS26AO75436 327 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HAUS5O94927 633 aa14.48□□□□□ -0.09
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC16A8O95907 504 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms