RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DSELQ8IZU8 1212 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 C9J4A7 227 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TP73O15350 636 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CREG1O75629 220 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 RECKO95980 971 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CD63P08962 238 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 F8A1P23610 371 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PTPN4P29074 926 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ARSFP54793 590 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ERV3-1Q14264 604 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 TCTE1Q5JU00 501 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2L3Q8NG85 312 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 DLG3Q92796 817 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 CHST8Q9H2A9 424 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC16A5O15375 505 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC16A8O95907 504 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 GSTA2P09210 222 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SAT1P21673 171 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 GRIA3P42263 894 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC12A2P55011 1212 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKN2DP55273 166 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SP140Q13342 867 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPN12Q6ZSI9 719 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC25Q86WR0 208 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 LINGO1Q96FE5 620 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 MED8Q96G25 268 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS39Q96JC1 886 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC138Q96M89 665 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ACTL8Q9H568 366 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PARVBQ9HBI1 364 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 MGAQ8IWI9 3026 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 KRT87PA6NCN2 255 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ERGP11308 486 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ALAS2P22557 587 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMB5P28074 263 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 LY6DQ14210 128 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 FCRL6Q6DN72 434 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 SYVN1Q86TM6 617 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF480Q8WV37 535 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 DPH7Q9BTV6 452 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 NLNQ9BYT8 704 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PHACTR1Q9C0D0 580 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKMY1Q9P2S6 941 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 POLHQ9Y253 713 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CACNA1GO43497 2377 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 CDC14CA4D256 554 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 TERTO14746 1132 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 RORAP35398 523 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 GABRA4P48169 554 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 ABATP80404 500 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 GRM7Q14831 915 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-210ENST00000505941 LINC00303Q3SY05 128 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms