RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2A13Q16696 494 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LONRF1Q17RB8 773 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR83Q9NYM4 423 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNX12Q9UMY4 172 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DSCR3O14972 297 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTSVO60911 334 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CATP04040 527 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMPK1P30085 196 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLCN7P51798 805 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXL2P58012 376 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAPSNQ13702 412 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NADK2Q4G0N4 442 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CALML6Q8TD86 181 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT9Q9BW91 350 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC22A11Q9NSA0 550 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD12Q6UB98 2062 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0J9YVX5 310 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1W2PPV9 198 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHEP01854 428 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGEA3P43357 314 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCGRP47871 477 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATCAYQ86WG3 371 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLEC1AQ8NC01 280 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMPDL3AQ92484 453 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIB2Q96AX9 1013 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC30A3Q99726 388 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCSK5Q92824 1860 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLNCQ14315 2725 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CES2O00748 559 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPM1O60762 260 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC1A2P43004 574 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CUL1Q13616 776 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAA25Q14CX7 972 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF549Q6P9A3 640 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEK10Q6ZWH5 1172 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FKBP10Q96AY3 582 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKP4Q99569 1192 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DPH7Q9BTV6 452 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASIC3Q9UHC3 531 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HYKKA2RU49 373 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF839A8K0R7 811 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO1CO00159 1063 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALBP02768 609 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UMODP07911 640 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGAXP20702 1163 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSD17B2P37059 387 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YBX1P67809 324 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF10Q5QP82 559 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNJ9Q92806 393 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INPP5DQ92835 1189 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MFRPQ9BY79 579 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHRS7Q9Y394 339 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms