RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	CES4A	Q5XG92	561 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	MIPEP	Q99797	713 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	PADI4	Q9UM07	663 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	SPTBN2	O15020	2390 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	SDHB	P21912	280 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	GNGT1	P63211	74 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	CDC16	Q13042	620 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	LCP2	Q13094	533 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	RBBP7	Q16576	425 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	KLHL35	Q6PF15	583 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	APOLD1	Q96LR9	279 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	NRTN	Q99748	197 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	HAUS8	Q9BT25	410 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	EDEM2	Q9BV94	578 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TTC19-208	ENST00000497842	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GRK6	P43250	576 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	IPPK	Q9H8X2	491 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		27.57	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OR6C74	A6NCV1	312 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GIPC1	O14908	333 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	LSP1	P33241	339 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	SLC14A1	Q13336	389 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	LCTL	Q6UWM7	567 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		27.56	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	FLRT2	O43155	660 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ITM2A	O43736	263 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OTC	P00480	354 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	TSPAN8	P19075	237 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GPR3	P46089	330 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CCNG1	P51959	295 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	EPHA4	P54764	986 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	KIR2DS3	Q14952	304 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OOSP2	Q86WS3	158 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OR4K3	Q96R72	315 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF382	Q96SR6	550 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		27.55	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842		A0A1W2PPV9	198 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	PIPSL	A2A3N6	862 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CLGN	O14967	610 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ZW10	O43264	779 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	UBXN7	O94888	489 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	NPPB	P16860	134 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	AMD1	P17707	334 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	GNAZ	P19086	355 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CCR10	P46092	362 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	PKNOX1	P55347	436 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	PRKAA1	Q13131	559 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	LSMEM2	Q8N112	164 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OR10G6	Q8NH81	332 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	TAC3	Q9UHF0	121 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ACACB	O00763	2458 aa		27.54	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	ISM1	B1AKI9	464 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	BTN3A3	O00478	584 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OR7A17	O14581	309 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CCNDBP1	O95273	360 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	CHRNG	P07510	517 aa		27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
TTC19-208	ENST00000497842	OCRL	Q01968	901 aa		27.53	■■■□□ 2

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