RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	DCLK2	Q8N568	766 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF614	Q8N883	585 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	HDAC11	Q96DB2	347 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CHST11	Q9NPF2	352 aa		5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	P4HA2	O15460	535 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	DDHD2	O94830	711 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CPT2	P23786	658 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	GSDMD	P57764	484 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	GCNT1	Q02742	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	VEZF1	Q14119	521 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TNIP1	Q15025	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	WBP1	Q96G27	269 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	MUS81	Q96NY9	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	FEV	Q99581	238 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CPNE1	Q99829	537 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188		O00370	1275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CLDN4	O14493	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CD22	P20273	847 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	LIMK1	P53667	647 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF195	O14628	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	FIBP	O43427	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	DCX	O43602	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	EXTL3	O43909	919 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	NXPH2	O95156	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ACSL3	O95573	720 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	DPEP1	P16444	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CYP11B2	P19099	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PAX9	P55771	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	RBPJ	Q06330	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	RASA2	Q15283	850 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	C10orf90	Q96M02	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	KRT12	Q99456	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	TLE6	Q9H808	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188		Q9H8V8	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNF146-208	ENST00000495188		A0A0J9YWU9	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.1 ms