RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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PRPF40A-210ENST00000489741 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.21□□□□□ -1.42
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PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ13O60928 360 aa6.21□□□□□ -1.42
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