RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TARM1B6A8C7 271 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 E7ENX8 843 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 E7EQ34 232 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A5O15375 505 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 C8GP07360 202 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 DLSTP36957 453 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 TAS2R39P59534 338 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 IL2P60568 153 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 TAP2Q03519 686 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 GPS2Q13227 327 aa20.14■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 SP140Q13342 867 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.14■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 CT55Q8WUE5 264 aa20.13■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 PCMTD2Q9NV79 361 aa20.13■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.12■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 LCN10Q6JVE6 187 aa20.12■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 ICE2Q659A1 982 aa20.11■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.11■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.1■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 C21orf140B9A014 251 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ERVH48-1M5A8F1 160 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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ACTB-211ENST00000480301 GP5P40197 560 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 GCGRP47871 477 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 POU4F1Q01851 419 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ACTB-211ENST00000480301 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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