RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480205.5

PSMD6-208, Transcript of proteasome 26S subunit, non-ATPase 6, human

TSL 3

Gene PSMD6, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMD6-208	ENST00000480205	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	NT5C3B	Q969T7	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	NUS1	Q96E22	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	OR2M4	Q96R27	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PSMD6-208	ENST00000480205	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C21orf140	B9A014	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	KDELR3	O43731	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TMEM63A	O94886	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PRSS23	O95084	383 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NUDT3	O95989	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	F9	P00740	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	AMY1A	P04745	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	IVL	P07476	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ITGAM	P11215	1152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FGF5	P12034	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FOLR1	P15328	257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GCSH	P23434	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NDST2	P52849	883 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GCNT1	Q02742	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GPS2	Q13227	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MTA1	Q13330	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	KYNU	Q16719	465 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	EMC1	Q8N766	993 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	GPR83	Q9NYM4	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSMD6-208	ENST00000480205	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62

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