RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478279.5

APTX-222, Transcript of aprataxin, human

TSL 1 (best)

Gene APTX, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APTX-222	ENST00000478279	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	OLIG2	Q13516	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	BRD3	Q15059	726 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TAZ	Q16635	292 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	APOL2	Q9BQE5	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	GBA3	Q9H227	469 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.08	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	HACD1	B0YJ81	288 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TARM1	B6A8C7	271 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279		H7C0S8	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	QSOX1	O00391	747 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CTSV	O60911	334 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FTH1	P02794	183 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CDKN2B	P42772	138 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZBED6	P86452	979 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DBN1	Q16643	649 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SYTL3	Q4VX76	610 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	KAZN	Q674X7	775 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	P3H4	Q92791	437 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	MENT	Q9BUN1	341 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279		E9PLN8	166 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TTI1	O43156	1089 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FKBP9	O95302	570 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	HEXB	P07686	556 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TNNT1	P13805	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	IGFBP2	P18065	325 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	GRB7	Q14451	532 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ITIH4	Q14624	930 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	PCOLCE	Q15113	449 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	AGAP11	Q8TF27	550 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	IL17F	Q96PD4	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	HCFC1	P51610	2035 aa		10.06	□□□□□ -0.8
APTX-222	ENST00000478279	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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